一般来说，影响菌种生长的主要因素包括碳源、 碳氮比、DO、pH和温度，碳源、碳氮比和DO是影响好氧反硝化菌脱氮效果的主要因素，而pH的影响不大。菌体适合生长在中性偏碱性的环境下．由于菌体能同时进行硝化和反硝化，两个反 应部分产生的酸碱度可以相互平衡．导致体系内的 pH相对稳定，因此以下主要讨论碳源、碳氮比和 DO等因素对好氧反硝化的影响。
1.碳源和碳氮比
菌株需要消耗碳源来提供好氧反硝化过程中所需能量和电子．采用不同碳源对菌株的
生长、脱氮效率等均有影响。不同的碳源对菌种的影响不同，这是因为反硝化是氧化还原反应．需要碳源提供电子．而不同的碳源本身在氧化还原体系中所处的位置、还原性以及被菌体利用的容易程度都会影响其向反硝化酶系提供电子的能力，从而影响脱氮效果。有研究表明，碳源的化学结构和分子质量对反硝化效率影响很大，一般结构越简单、分子质量越小的碳源越容易被菌体利用，越利于反硝化的进行。
2 . DO
氧气在生化系统中参与反应，并且与硝氮、亚硝氮协同呼吸．在整个脱氮过程中是必不可少的底物，但针对不同菌株的试验结果表明，DO 对脱氮的影响效果并无统一规律。
3. 其他影响因素
异养硝化一好氧反硝化菌可以同时利用 NH4+-N、 NO2--N、N03--N作为氮源，不同氮源之间存在相互影响。
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