养殖水体中含氮有机物的转化分为两个途径，一个途径是通过氨化作用和硝化作用转化为硝酸盐最终被藻类吸收；另一个途径是通过反硝化作用把硝酸盐转化为氮气而排出水体。
第一个途径一般有三个步骤：
第一步，残饵、粪便、死藻、动物尸体、施入的有机肥等含氮的有机物在微生物的作用下转化为氨氮；
第二步，氨氮在亚硝酸菌的作用下转化为亚硝酸盐；
第三步，亚硝酸盐在硝酸菌的作用下转化为硝酸盐，藻类利用其为营养物质。
可以看到，这个途径的基本步骤中，都离不开微生物或生物的转化作用。实际上，第二个途径，也需要微生物的介入。
这里面涉及到几个生化作用：
1、氨化作用
氨化作用又叫脱氨作用，微生物分解有机氮化物产生氨的过程。很多细菌、真菌和放线菌都能分泌蛋白酶，在细胞外将蛋白质分解为多肽、氨基酸和氨（NH3）。
2、硝化作用
3、反硝化作用
在缺氧条件下，能够把硝酸盐还原为亚硝酸盐，再把亚硝酸盐还原为氮气（N2）的一类细菌叫做反硝化细菌，也叫脱氮细菌。反硝化细菌在缺氧条件下，硝酸盐还原为亚硝酸盐，亚硝酸盐再还原为氮气（N2）或一氧化二氮（N2O）的过程叫做反硝化作用，也叫脱氮作用。
可以理解的是，如果养殖水体中这几个生化作用或者说生化过程减弱、或者失去平衡，其中的氨氮、亚硝酸盐等物质就无法及时消纳，也就会在养殖水体中保持较高水平。
阿拉丁环保在现场实际的操作经验和建议：
1、改底解毒：采用含量20%、50%的过硫酸氢钾氧化改底，同时具有一定的消毒作用。改底后，使用有机酸解毒；
2、快速补菌：采用高效的有益菌，改底后立即使用，在“生物空白期”快速建立有益菌群优势，提高微生物密度和作用效率。这一过程需要连续强化，一般隔一天再补充一次。
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